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流式細胞術實驗雖不復雜，但數(shù)據(jù)分析環(huán)節(jié)充滿挑戰(zhàn)，尤其是圈門方式的選擇，直接影響結果的準確性與客觀性。面對老師們的疑惑：“圈門稍有變動，結果就大相徑庭，主觀性好強啊！”羅工給出了明確指導——分析前深挖指標關系，按邏輯圈門。

流式數(shù)據(jù)展示往往僅是一角，例如雙染結果包含雙陽、雙陰、單陽細胞，而三染則涉及更多組合。實際信息量巨大，遠超直觀展示的范圍。因此，主觀分析如同盲人摸象，容易失真。

為提升分析客觀性，流式數(shù)據(jù)分析中引入了如flowsom等聚類分析插件。此工具能自動識別細胞，提供客觀分類。安裝flowsom需準備R語言環(huán)境。在flowjo軟件中，選擇數(shù)據(jù)、預估數(shù)（通常為2的n次方），并運行分析。

分析流程涉及關鍵步驟：選擇通道、設定數(shù)、生成圖像。通過flowsom，自動識別細胞，排除非目標，篩選出值得分析的細胞亞，如CD4T、CD8T、NK、NKT、B細胞、單核細胞等。

分析后，借助其他插件如cluster可視化亞抗原表達，明確細胞特性，為深入分析奠定基礎。flowsom插件簡化了復雜分析過程，幫助避免圈門錯誤，提升數(shù)據(jù)準確性。掌握這一技巧，數(shù)據(jù)分析不再是難題，而是科學探索的有力工具。